若小孩因消化不良引起发烧，首先要控制体温，尽量不选择对胃肠道造成过重负担的退烧药物。

此外要结合孩子的表现，如有无大便干结，或近期大便的情况。如果孩子出现厌食或腹胀的情况，要根据具体情况使用利于消化、促进排便的药物。常使用的治疗药物为健胃消食片或保和丸。如果孩子最近出现大便干结，也可以适当选择导赤丸或小儿导赤片，促进大便排泄。