幽门螺杆菌的检查方法有多种，主要如下：

1、非侵入性：碳13和碳14呼吸试验、抽血查幽门螺杆菌抗体以及查粪便的抗原等，都属于非侵入性的检查；

2、侵入性：可在胃镜下取胃黏膜组织做快速尿素酶试验，或是取胃黏膜组织做幽门螺杆菌的培养。也可以取胃黏膜组织做病理，在病理下观察有没有幽门螺杆菌以及做PCR检查，以上都是属于侵入性的检查方法。

部分患者没有感染过幽门螺杆菌，而且没有特殊的症状，只是进行体检的筛查，可以选择非侵入性的检查方法。若是根除幽门螺杆菌后，再次感染或是根除失败，可以选择在内镜下夹取胃黏膜组织，进行幽门螺杆菌的培养和进行药物敏感试验。可根据药物敏感性试验，选择根除幽门螺杆菌的药物。

在临床中，根除幽门螺杆菌病之后，通常会选择碳13或碳14的呼气试验进行复查，而不选择幽门螺杆菌的抗体。因为如果既往感染过幽门螺杆菌，抗体会呈阳性，即使进行根除治疗，患者血液中的抗体仍然会体内存留相当长时间，此时查抗体仍是阳性，并不能提示是否根除了幽门螺杆菌。