幽门螺杆菌本身就定植在人体口腔的牙菌斑里，通过经口传播，有可能通过唾液，传播给周围共同用餐的人士。幽门螺杆菌一旦定植在人体的胃窦，现在通过多年的，杀幽门螺杆菌的治疗，有部分会上移到胃体或胃底。

幽门螺杆菌在地球上已经存在了几亿年，在自然环境中有少量。幽门螺杆菌是一个微需氧菌，主要定植在人体的口腔，定植到胃里的原因目前还不清楚，有的觉得是通过进食什么吞咽进去的，但是目前并不明确。如果通过经口传播，幽门螺杆菌其实通过简单的消毒，或者微需氧菌离开口腔和胃的环境，其很快就死亡。所以幽门螺杆菌，多数都是经粪口途径传播的，人体共用餐具和共用碗筷，有可能会出现交叉传染，因此建议尽量分餐、公筷，就可以达到避免幽门螺杆菌交叉感染的可能。