耳朵里有囊肿建议手术切除，因为囊肿是额外长的东西，通过任何的局部用药或口服药，都很难使囊肿完全消除。耳朵里长囊肿的情况并不常见，如果确定耳道里是有囊肿，这种囊肿一般是长在外耳道，很少长到中耳里。长在外耳道的囊肿，如果不切除可能会出现逐渐长大，堵塞外耳道，使听力下降或产生耳闷、耳朵不适的感觉，也可能会出现囊肿感染造成外耳道炎的情况，所以如果一旦确诊耳道有囊肿，需要尽快手术切除。
对于小孩子来说，如果耳道里长囊肿进行手术切除，一定要进行全身麻醉，否则小孩子不可能配合。对于成年人来说，大部分人可以在局部麻醉的情况下进行手术。局部麻醉时，耳道外没有任何伤口，耳朵周围可能会打麻药，在耳道里会有一个切口，通过切口将囊肿离开，完成剥离后，将囊肿完全拿掉，在耳道里进行切口的缝合，本身是一个小手术。
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