若由感染引起心肌酶升高，则治疗时需积极抗感染。若细菌感染所致，应针对性给予抗生素治疗，若为病毒感染导致，必要时清除病毒或适当提高抵抗力。心肌酶高提示心肌细胞存在变性或水肿，主要为改善心肌能量代谢，促进心肌细胞修复。一般通过口服营养心肌药物，如糖二磷酸钠口服液、辅酶Q10、左卡尼汀口服液等口服常用药，或益气养心的中成药。
心肌酶升高特别明显，甚至出现肌钙蛋白升高，或合并肌酸肌酶即CK升高明显，口服药物吸收效果不佳时，必要时可进行静脉输注。通过静脉快速滴注药物到达心脏，促进心肌修复，常用静脉营养心肌的药物包括注射用磷酸肌酸钠、果糖二磷酸钠注射液等，可为心脏供能，改善心脏能量代谢。
