胃窦活检是指胃镜下取胃窦部黏膜组织进行病理学检查，用于确诊胃部疾病的具体程度以及性质。例如患者存在萎缩性胃炎，则可以查看其程度，是否伴随着肠化生或者不典型增生，有无上皮内瘤样变；如果是患有溃疡，则查看是恶性的溃疡还是良性的溃疡；如果患有癌症，则检查是腺癌还是印戒细胞癌；如果患有息肉，则查看是增生性息肉还是炎症性息肉；或者检查有无幽门螺杆菌感染等。该检查属于胃部疾病诊断的金标准。
因为很多病变单凭胃镜很难区分，也很难确诊，需要借助活检才能确诊。一般是在胃镜下有病变的部位取下一块组织，对于这块组织做病理切片，然后在显微镜下观察组织细胞的形态以及腺体的改变等。必要时还要做特殊的染色和标记，才能最终确诊。内镜医生通常对有问题的胃，会常规进行活检送病理科检查，明确具体的性质，才能够更好的对症治疗。
