脑电图对于脑炎检查是非常重要的辅助手段，但并不是确诊的唯一辅助手段。脑炎诊断主要是靠临床表现，同时结合脑电图、影像学等。如果脑炎引起脑实质损害，如果严重，可能在脑电图有异常表现，比如脑电图出现尖波、慢波，严重可能会出现双向波，但是有些轻微病毒感染可能只影响脑皮层或脑膜，这时患者脑电图表现正常。但如果有头痛、发热等症状，甚至查出有脑膜刺激征，根据临床依然能诊断脑炎。脑电图在脑炎诊断中有着非常重要的辅助诊断价值，通常反映脑电波活动，正常或异常可提示脑神经功能损伤。因此对于脑炎损伤神经元疾病，有着独特的诊断价值。
