肛周脓肿早期可进行西医治疗，应用抗生素，症状轻微时可以得到缓解。同时中医治疗疗效良好，也可以使肛周脓肿得到很好消散，部分情况可能完全治愈。肛周脓肿还需区分深浅程度，表浅肛周脓肿早期可能溃破，深部肛周脓肿早期需要特殊重视。

需观察患者体温情况，比如是否伴有排便、排尿不畅。如果伴有此类症状，早期患者需要进行影像学检查，观察有无脓腔形成。存在脓腔形成不能切开时，可应用超声介导下置管引流。此时脓肿虽然较小，但置管引流排出脓液后，患者症状可以得到解除，其效果显著。