牙列不齐的直接原因为牙量骨量不调，即牙量相对大而骨量相对小，牙量骨量不调受多因素的影响。总体可以归纳为遗传因素和环境因素两大类；
1、遗传因素：是牙列不齐的原因之一，人类演化过程中由于咀嚼器官功能表现出逐步退化减弱的趋势，而且各咀嚼器官之间退化不平衡，肌肉退化最快颌骨次之，牙齿退化最慢，另外牙齿及颌骨的形态、大小也受遗传的影响；
2、环境因素：乳恒牙替换过程中出现牙齿萌出或脱落的时间顺序异常，导致牙列拥挤、长期咬下唇等口腔不良习惯，可造成下前牙舌倾、拥挤，另外长期使用精细柔软的食物可使颌骨发育受到影响，导致牙量骨量的不调。