试管胎停后第二次移植是否会有影响，要具体情况具体分析，观察胚胎移植的原因。胚胎停育大致有内分泌、遗传、感染、免疫、凝血、全身因素等，此外还有很多原因是常规检查手段发现不了的。

如果常规的检查手段发现的问题，是否也影响着对后续的移植，在此之前需要做什么治疗。假如这些问题都得到了纠正，或者得到规避，理论上不影响第二次胚胎移植。

另外第一次胚胎停育，如果中间因为胚胎停育需要做清宫、流产等，还要评估宫腔操作之后，做第二次移植之前，有没有一些需要去解决，或者等待的问题。

刚刚做完流产，内分泌子宫内膜还没有修复到允许的程度，可能就需要病人多等待一段时间，等恢复正常月经之后，等子宫内膜的损伤得到修复，等激素降到正常范围之后，再去做准备第二次的胚胎移植。

另外如果胚胎停育的原因是遗传方面的问题，又通过遗传方面的问题，进而发现了父母一方，或者双方存在着一些染色体的异常，就要重新评估接下来的治疗方案。

也就是这次胚胎移植是否存在胚胎异常，胚胎的异常是否意味着剩余的胚胎，冻存胚胎也有类似的问题。如果也有同样的问题，再次移植可能也会出现胚胎停育的风险等。综合情况比较多，需要综合判断，来看看胚胎停育有没有原因可查，对后续的进一步的移植有没有影响。