试管婴儿胚胎移植的过程中，通常没有疼痛感觉。胚胎移植时是采用生物安全性材料制备的软管，管径外径大约是5mm，其经过阴道、宫颈深入到子宫内。软管在不扩张宫颈的情况下，能顺畅放到子宫内，不会引起疼痛，大部分女性能轻松度过胚胎移植的过程。

但是也有少数情况，如个别女性宫颈发育较弯曲、宫颈内腔较细窄，即使是软的胚胎移植导管，在插入过程中也会受到一定阻碍。此时医生会调整导管的角度和弯曲程度，来适应性进入宫腔。在此过程中可能会有轻微疼痛，一般整个过程为十几秒，或1-2分钟内完成，大部分女性能够耐受。