肛周脓肿一次切开引流找到内口后一次挂线解决两个手术，和形成肛瘘后再做手术实际上一样，只不过肛周脓肿根治术只是缩短手术时间，但手术选择适应症存在严格要求。即肛周脓肿一定比较浅表，而且脓肿比较局限、内口十分清晰，否则比较大的脓肿、感染性较强的脓肿，勉强一次性手术很容易损伤过多括约肌。肛周脓肿切开引流后伤口会排脓，会逐渐收缩，收缩以后形成的瘘管比较局限，形似一条线。做手术可以减少周围组织损伤，主要还是减少肛门括约肌的损伤。
肛瘘手术分两次做也存在一定的道理，对于比较深、比较复杂的肛瘘，建议分两次进行手术。手术并不存在非常大的区别，而对于缩短时间和手术适应症的选择则十分值得考虑。
