肺内磨玻璃结节危害主要在于导致发生磨玻璃结节现象的病因，如病因为浸润性肺癌，磨玻璃结节在一定阶段，会逐渐由磨玻璃结节发展成实性结节，然后逐渐长大，并且通过血行转移、淋巴转移，以及蔓延等多种方法向外界转移，这才是磨玻璃结节最终对人体的危害。

肺内磨玻璃结节可由不同病因所致，如过敏性肺炎、原位癌，甚至浸润性肺癌等。