肾囊肿的患者，挂号肾内科还是泌尿外科，需要根据疾病情况决定，具体如下：

1、泌尿外科：单纯性的肾囊肿，通常建议到泌尿外科进行就诊。肾囊肿＜4cm时，通常不需要进行进一步处理，而肾囊肿＞4cm，建议积极地采取手术治疗。对于复杂性的囊肿，尤其是考虑可能合伴恶性病变的囊肿，也需到泌尿外科就诊，进一步进行手术治疗；

2、肾内科：如果是遗传性疾病引起的肾囊肿，如多囊肾等，疾病后期引起肾功能的改变，甚至出现尿毒症的情况，需要到肾内科进行就诊。通过肾内科血透以及改善肾功能的治疗，让患者得到救治和改善。

因此肾囊肿的患者，需要具体区分病情，进一步选择合适的就诊科室，达到针对性治疗。