单纯性疱疹病毒性脑炎是临床上的急症、重症，首选药物是抗病毒药物，抗病毒药物又包括以下几种：
1、阿昔洛韦：是最常用也是最古老的药物，也叫做无环鸟苷。这个药物虽然古老，但是截至目前仍然没有淘汰，是治疗单疱脑炎的一线用药之一；
2、更昔洛韦：对于巨细胞病毒脑炎效果更好，对单纯疱疹病毒性脑炎也有治疗作用，对阿昔洛韦效果不好的患者仍然有效，是相对的新药，也可以作为一线选择，直接用更昔洛韦治疗也可；
3、膦甲酸钠：是目前比较新的抗病毒药物，对于病毒性脑炎的治疗比更昔洛韦和阿昔洛韦起效更快，患者的预后也更好，也可以与更昔洛韦或者阿昔洛韦联合使用。用这个药的时候，需要充分水化，避免发生不良反应。
除了西药抗病毒之外，也可以用中成药来进行抗病毒治疗，静脉用药包括醒脑静注射液，口服用药包括蓝芩口服液及抗病毒口服液，对于疾病也有一定的帮助，可以起到辅助治疗作用。
