甲状腺球蛋白抗体和甲状腺微粒体抗体一样，都是免疫标志物。它的升高见于桥本氏甲状腺炎，但甲状腺球蛋白抗体的高低可能与病情的严重程度不一定平行，也就是甲状腺球蛋白抗体可以很高，但甲状腺功能可以是正常的，这个时候对人体没有什么危害，不需要治疗。也有的时候甲状腺球蛋白抗体是阴性，但甲状腺功能较低，这个时候反而需要治疗。
如果不是甲状腺球蛋白抗体，而是甲状腺球蛋白升高，则是另一种意义。球蛋白是甲状腺滤泡细胞所分泌的一种蛋白，代表甲状腺组织还在工作。一般甲状腺球蛋白的测定是用于甲状腺癌、甲状腺乳头状癌术后关于肿瘤是否复发的一个标志，一般进行甲状腺全切术后，甲状腺球蛋白的水平很低，如果术后再进行甲状腺球蛋白测定，发现甲状腺球蛋白升高，可能代表甲状腺乳头状癌复发。