普通肠镜与超声肠镜的区别主要如下：

1、普通肠镜：通过肛门进镜后可以观察黏膜面有无改变，如果黏膜面出现息肉、溃疡，均可被普通肠镜所发现；

2、超声内镜：属于普通肠镜后的进一步检查，如果发现有隆起样病变，但黏膜面正常，此时则为进行超声内镜的指征。在病变部位通过超声探头的作用，可以观察黏膜下层是否存在障碍性病变，如果发现病变、隆起，则可以判断病变性质，如高回声、低回声、中等回声。还可以判断疾病的来源，比如是间质瘤还是脂肪瘤还是其他病变。