舌头囊肿引起的原因很多、很复杂，可能由于局部刺激因素，如患者口内牙齿出现锋利的锐尖，或由于龋病而导致牙齿破损，其边缘过于锋利，或者局部牙髓炎、根尖周炎以及牙龈炎、牙周炎、食物嵌塞、牙结石等致病因素导致口腔感染，也有可能引起刺激导致舌头囊肿发生。部分患者还由于原发性囊肿或由于其局部相关疾病以及舌头的破损所引起。
对于各种原因所引起的舌头囊肿，建议患者尽早到正规医院口腔科或口腔医院的口腔颌面外科，找专业口腔颌面外科医生进行检查，进行相应触诊，并且进行舌头囊肿周围组织的观察等，必要时进行相应CT或磁共振检查。进行精准诊断后，根据其囊肿大小、范围，采取相应不同的治疗方案。
