磷酸铝凝胶作为黏膜保护剂，具有一定促进黏膜修复、增生及上皮细胞增生的作用，有一定治疗糜烂性胃炎的作用。由于磷酸铝凝胶含有磷酸铝成分，铝元素能促进胃黏膜上皮分泌生长因素如成纤维生长因子等，所以能促进上皮细胞增生。另外，磷酸铝凝胶能附着在胃黏膜表面，阻隔开胃酸及其它损伤因子对胃黏膜的直接损伤和破坏，促使上皮细胞能自身修复。磷酸铝凝胶还有调节黏膜免疫的作用，也能对黏膜修复起到一定促进作用。

但是如果糜烂性胃炎的致病因素是幽门螺杆菌，只是应用单一的磷酸铝凝胶，治疗作用较有限。此时除使用磷酸铝凝胶外，还应给予病因治疗，即去除幽门螺杆菌的影响。因幽门螺杆菌能分泌细菌毒素、尿素酶等损伤因素，会直接导致胃黏膜损伤、糜烂。所以如果该致病因素没有去除，仅靠修复，可能糜烂会反复发生。因此在治疗糜烂性胃炎时，除进行局部治疗措施外，还应进行病因治疗，将最终病因去除，糜烂才能得到根治性治疗。