宝宝咳嗽通常先挂小儿内科或小儿呼吸科，若这个科判断认为疾病与耳鼻喉科疾病相关，可能会建议再去耳鼻喉科进一步地进行诊治。
通常宝宝咳嗽挂小儿呼吸科较为合适，因为多数宝宝的咳嗽，都是呼吸道疾病所引起。不管是上呼吸道咽部的感染、鼻部的感染，还是下呼吸道中的支气管炎、肺炎，这些都属于呼吸系统的疾病。若没有小儿呼吸科，可以挂小儿内科，因为小儿内科对于儿童呼吸道常见疾病的诊治水平比较高。
此外，部分特殊情况，如宝宝咳嗽时间比较长，且伴有鼻塞、流鼻涕等过敏性鼻炎的表现，这种咳嗽往往由过敏性鼻炎鼻后滴流所引起，在小儿内科或呼吸科就诊后，建议还要去耳鼻喉科进行耳鼻喉镜的检查，来确定是否有鼻炎或鼻窦炎，以及腺样体肥大。
