巴氏腺炎是由细菌感染引起的疾病，所以根据患病原理需要进行抗细菌治疗。临床医生根据经验都选择敏感的广谱抗生素，可以口服、可以肌注，也可以静滴，都会起到比较好的临床效果。

巴氏腺炎有时会形成巴氏腺脓肿，局部会形成脓包，比较痛。如果抗炎治疗不好，需要做小手术，就是在脓包上切个小口清除里边的脓液，先用无菌盐水清洗干净，再用抗生素治疗，会产生更好的临床效果。同时还要注意休息、增加营养、提高机体免疫力，也可以多喝水。如果出现发烧，选择物理降温、药物降温都可以。