甲状腺肿的治疗方法是多种多样的，首先要判定甲状腺肿的原因、程度。如果甲状腺肿是生理性的，青少年引起或者妊娠期引起，通过简单的碘摄入量增加就能满足要求了，不需要药物治疗更谈不上手术治疗。如果甲状腺肿是良性的，但是导致功能性改变，比如甲亢比较明显需要手术；没有甲亢但是有明显的外观上的影响或者有压迫症状，也需要手术治疗。如果这些东西都没有，单纯性的良性结节，可以观察不需要手术治疗。另外一个比较常见的现象，甲状腺肿大跟肿瘤是相关的，要优先考虑手术治疗。
甲状腺肿大手术方式有很大差别，如果结节是局限一侧比较明显，仅切除部分甲状腺组织就可以了；如果比较大而且双侧都有，需要全甲状腺切除；如果甲状腺癌引起肿大，手术范围不仅局限于甲状腺本身，可能还要做相应的淋巴结清扫等。甲状腺是良性结节，同时也没有功能上的改变、也没有压迫症状、也不考虑有恶性变的情况，动态观察、定期做超声检查就可以了。甲状腺结节处于很缓慢的发展，甚至处于停滞状态，不需要做任何手术干预。