小三阳S1抗原阳性只能说明有乙肝病毒的复制，有传染性，而不能说明病情的严重性，也不能反映病情的严重程度。因为小三阳S1抗原是病毒复制的指标，而不能反映肝脏的损伤情况。
这种情况下，需要进一步检测乙肝病毒DNA，又叫HBV-DNA，HBV-DNA是乙肝病毒复制的金标准。通过检测乙肝病毒DNA，才能更准确反映乙肝病毒复制的情况。同时还要做生化学检查，就是肝脏生化指标检查，包括转氨酶、胆红素、白球比，来反映肝脏受损伤程度。也要做肝脏影像学检查，包括肝脏彩超或CT，甚至还可以做核磁，来明确肝脏影像学上的变化。通过这些检查，才能充分评估小三阳S1抗原阳性的情况下，对肝脏造成的损伤如何。
通过这种全面的检查后才能对患者病情，做出准确判断。根据这些检查，可以制定具体的治疗方案，比如是否需要进行抗病毒治疗，是否需要保肝治疗。
