肛瘘手术后，中医医院需换药、坐浴以及仪器治疗；西医的治疗为换药及仪器治疗。临床的护理主要包括坐浴及药物湿敷，操作相对较简单。

若患者进行植入性手术，需将生物材质植入体内，术后坐浴时间需尽量晚些。同时，术后恢复正常饮食以及排便的时间，也需相应推迟，一般需推迟48-72个小时。若患者进行传统手术，术后24小时患者即可进行正常的饮食、洗澡、坐浴，以及局部湿敷药物、理疗等。