服用硝酸异山梨酯对于头部的血管可能会有一定的扩张作用，部分患者服用硝酸酯类药物后，可能会出现头痛等不适症状，属于比较常见的不良反应，如果头痛相对较轻，能够耐受，也可继续服药。但如果头痛比较剧烈，则需要立即停止药物，也可考虑使用镇痛类药物进行缓解。此外，针对心肌缺血的药物治疗，可换用β受体阻滞剂或非二氢吡啶类钙拮抗剂及钾通道开放剂，如尼可地尔等代替硝酸异山梨酯的抗缺血作用。由于该药物的扩血管作用还可能会引起血压降低，如果程度相对较轻，则可停药并暂时观察。
硝酸异山梨酯属于硝酸酯类药物，作用机制是在体内产生一氧化氮，而一氧化氮属于比较强的扩张血管物质。服用硝酸异山梨酯后，能扩张心脏表面的冠状动脉，通过扩张冠状动脉，改善心脏供血，缓解心肌缺血、缓解心绞痛，属于针对冠心病常用的抗缺血治疗药物。但由于存在扩张血管的作用，可能会产生部分不良反应。
