手术不能根治萎缩性胃炎，萎缩性胃炎主要是胃黏膜的病变，由于胃黏膜上皮细胞数量的减少、腺体的减少、上皮细胞的萎缩，出现萎缩性胃炎。

萎缩性胃炎主要的致病原因是幽门螺杆菌的感染。​其范围相对比较广，有胃窦的，有沿着胃窦波及胃体，到胃角，有时候是到胃底这些范围。这样的大范围的黏膜改变，但肌肉层并没有问题。

现在有内镜下的黏膜切除，但是这样的大范围的切除会给病人带来很多的不利影响。切除完，黏膜修复了以后还是有可能出现萎缩。所以没有用这种手术的方式来治疗萎缩性的胃炎。

当然如果萎缩性胃炎伴有高级别上皮内瘤变，要通过胃镜切除发生上皮内瘤变的黏膜。但是对于萎缩性胃炎，目前没有手术的适应证。萎缩性胃炎的病因是幽门螺杆菌感染，要清除幽门螺杆菌的感染。

药物目前没有专门针对萎缩性胃炎的特效药物来进行治疗，也可以根据萎缩性胃炎病人的症状来进行对症治疗。另外，也可以尝试使用一些促进黏膜上皮细胞修复的一些药物，比如替普瑞酮(胶囊)、索法酮。

还有一些中成药，如胃复春(胶囊)、摩罗丹，都有国家批准的治疗萎缩性胃炎的适应证，可以去尝试。因为目前发生萎缩性胃炎的发病机制并不是非常的清楚，所以药物治疗的效果并不是十分理想。

对于萎缩性胃炎，重点是进行随访，一年或者是半年做胃镜检查，来观察萎缩性胃炎的进一步病变情况。