阑尾炎手术的后遗症主要有以下几方面，具体如下。
1、粘连性肠梗阻：做完阑尾手术后，腹腔经过手术操作后就会出现不同程度的小肠粘连。因为小肠有3-5米长，像一团麻绳一样错综复杂地盘在肚子里，只要腹腔得过炎症、做过手术，都会有部分小肠粘连，但是只要还能够经过水和食物，通常认为没有太大的临床价值和意义。而部分患者粘连得非常巧，比如上面的肠子压着下面的肠子，或者一个直的肠子出现特别大的转角，这种情况下就会出现所谓的粘连性肠梗阻，可能在术后马上出现，也可能在术后的半年、1年，甚至5年再出现，目前没有办法完全预防；
2、阑尾残株炎：通常将阑尾切掉后，不会贴着根将它扎掉，通常会留0.5-1cm。部分患者剩下的阑尾有点长或者即使剩得不长，但还是有一点炎症，通俗地讲就是大阑尾变成小阑尾，临床称其为阑尾残株炎。这种情况下，如果炎症比较轻，可以口服抗生素甚至静脉使用抗生素来抗感染治疗。如果反复发作并且症状比较重，唯一的治疗办法就是二次手术，将小阑尾再切一部分；
3、腹壁切口疝：是阑尾炎术后最常见的并发症。因为阑尾手术最经典的手术方式是在右下腹开一个口，还有一种比较严重的阑尾炎，会在右下腹开一个比较长的探查口。这种情况下，如果术后切口感染，切口的愈合能力就会明显下降，腹壁的强度变弱后就会向外膨隆而出现切口疝，通常也需要二次手术。
此外，阑尾是退化的肠道免疫器官，因此切除以后，对于机体的功能和免疫能力没有任何的影响，不必过于担心。