显微根管治疗就是用显微镜的方法进行根管治疗，根管治疗是由于龋病或其它原因导致牙髓发生病变，要进行根管处理，让牙齿不再发生疼痛、肿痛。显微根管治疗相对于常规根管治疗只是增加了显微镜，其它步骤与裸眼进行根管治疗的步骤相同。整个步骤包括牙齿的开髓、拔髓，拔髓以后进行冲洗，扩大根管，再用不同的材料药水进行清洗，并吸干，再进行牙胶的充填。

根管治疗目的主要是隔绝细菌，因为根管是一个管腔，如果根管治疗填充不密，细菌进去导致炎症也可以影响根管治疗的结果。所以显微根管治疗的步骤其实与普通根管治疗步骤相同，只是用显微镜扩大视野。