巧克力囊肿术后，通常可以注射GnRH，即促性腺激素释放激素。巧克力囊肿手术是经典的治疗方法，尤其是腹腔镜手术。虽然手术可以治愈巧克力囊肿，但因巧克力囊肿不能彻底根治，所以术后需要进行药物治疗。

通常药物治疗包括口服药物和注射针剂，口服药物包括口服避孕药和孕激素，而目前常见治疗方式是注射针剂，主要为GnRH。目前GnRH有多种剂型，根据不同生产厂家、不同剂型，包括皮下注射、肌肉注射等不同注射方式。并且需在治疗时根据患者雌激素水平进行反向添加。