舌咽神经痛没有自愈的可能性。舌咽神经痛是神经刺激性疾病，随着病程延长，很多患者的疼痛频率、疼痛程度都逐渐增强或更频繁，若没有去除疾病病因，不管是血管或肿瘤压迫、骨性刺激，自愈的可能性几乎没有。

舌咽神经痛可能有中间缓解期，即患者在这段时间疼，过一段时间有可能不疼，但再过一段时间又出现疼痛。出现中间缓解期的原因目前还不太明确，部分患者中间可能有段时间完全不疼，常以为自己已经痊愈。