强直性脊柱炎与遗传密切相关，但并非100%遗传。正常人发病率仅占0.2%-0.3%，通常不超过0.5%。如果家中一方患强直性脊柱炎，则子女遗传发生率相比正常发生率高出很多，通常可达15%-25%，但并非代表下一个子女100%罹患强直性脊柱炎。

已经发现HLA-B27，即人类白细胞抗原B27与强直性脊柱炎发病密切相关，发现强直性脊柱炎青年男性患者较多，存在家族聚集倾向，若爷爷、父亲、儿子检测HLA-B27均呈阳性，则发病几率较大。