女性系统性红斑狼疮的妊娠指征，主要参考红斑狼疮疾病活动情况，若疾病控制稳定时间>6个月，即可考虑妊娠。疾病控制时间越长、越稳定，妊娠期间发生风险越小。即便如此，仍有部分患者妊娠过程中出现疾病反复以及病情的活动。

通常若系统红斑狼疮不存在重要脏器损伤，如精神神经狼疮(狼疮脑病)，或严重血液系统受累如明显血小板下降，以及明显狼疮肾炎如尿蛋白水平极高等，皆为狼疮妊娠禁忌症。治疗时使用环磷酰胺、来氟米特、甲氨蝶呤等具致畸作用药物均会影响狼疮妊娠，通常建议停用此类药物超过半年。若应用来氟米特，需使用消胆胺进行长时间洗脱后才建议妊娠。因此，妊娠对于存在风湿免疫病的患者，尤其是系统性红斑狼疮高危患者而言，需特别谨慎。