吃恩替卡韦可将乙肝大三阳变为乙肝小三阳，但乙肝表面抗原不会转阴。乙肝五项包括乙肝表面抗原、表面抗体、核心抗体、e抗原、e抗体。如果是表面抗原、e抗原、核心抗体阳性为乙肝大三阳，而表面抗原、核心抗体、e抗体阳性为乙肝小三阳。
恩替卡韦是一类抗病毒药物，属于核苷酸类似物，可抑制乙肝病毒的复制，但不可将乙肝病毒从体内完全清除。目前抗病毒治疗的最终目的，是将乙肝病毒抑制到检测不到的水平，低病毒复制状态有助于肝脏炎症的控制，延缓肝纤维化、肝硬化的进展，也可在一定程度上降低肝癌的发生。
但是从乙肝病毒学角度来讲，仅处于病毒抑制状态而非清除。所以乙肝五项不可能完全转阴，大多由乙肝大三阳转化成为乙肝小三阳。极少数的情况身体免疫功能足够强，可将乙肝病毒清除，表现为乙肝表面抗原转阴，但乙肝表面抗体会转为阳性。
