医院眼科验光又称为医学验光，一般会使用睫状肌的麻痹药物，如阿托品眼膏、复方托品酰胺眼药水等进行散瞳验光，能鉴别出患者是真性近视还是假性近视，验光的数据更加准确；更重要的是医生在就诊的过程中还会排除相关的眼病，包括先天性青光眼、先天性眼底疾病等。验光完成后，医生会根据患者的眼部检查，屈光状态、眼位、调节力、双眼视功能、用眼习惯等十几项指标给出科学的配镜处方，同时指导如何科学用眼，防止进一步的近视加深发展。
眼镜店普通验光只是进行简单的主角验光，时间短、速度快，数据也没那么准确；如一位近视患者戴上300度、325度、350度、375度及400度五个矫正镜片都可以使矫正视力达到1.0，常规的验光只能在这五个矫正镜片中任意选一个作为配镜处方，有一定的随意性；而医学验光则根据被检者的眼位、调节、双眼单视及集合功能等检查结果选择其中某一个镜片，甚至会选择275度作为最后的配镜处方。
建议中小学生首次验光配镜一定要到专业的眼科进行医学验光，其结果直接关系到所配眼镜的准确性和舒适性。目标是让眼睛不仅是看得清，还要看得舒服、看得持久，才能起到一定的治疗和保健作用。