先天性肥厚性幽门狭窄手术后会复发，不充分手术后通常会复发，手术后患者常会出现呕吐，有的患者比手术前吐得轻。若切除过分，会造成手术后瘘引起腹膜炎。所以要求手术医生掌握火候，降低复发率。
先天性肥厚性幽门狭窄的主要临床表现是进行性加重喷射性呕吐，随着时间推移孩子体重不增，甚至出现消瘦，出现电解质紊乱，即低钾、低钠、低氯、低钙性碱中毒、抽搐等。
先天性肥厚性幽门狭窄最根本治疗办法是手术治疗。因为肥厚性幽门狭窄特点是解剖上幽门肌肉肥厚，但是和十二指肠交界地方突然变薄，像宫颈一样改变。手术要求技巧，在幽门环肌重型切开过程中，要求切得极到位，不能深，切开到充分，不能过分。
