骨结核最主要的危害是可以引起骨质破坏，在骨头周围形成较多冷脓肿。冷脓肿与一般细菌感染引起的热脓肿不同，通常无任何症状，不会产生红、肿、热、痛，但对周围组织破坏较为明显。

若脊柱结核导致骨质破坏，形成冷脓肿，严重时可能截瘫，患者截瘫部位以下运动、感觉全部丧失，仅能卧床，无法控制大小便，此类情况较为严重。轻微骨结核通常只长在股骨头、膝盖或肘关节处，早期症状较轻微，仅有稍许疼痛。但是后期膝关节、股骨头已被破坏，此时活动明显受限，且活动时可出现明显疼痛，可进行人工关节置换治疗。