中医治疗的精髓是辨证施治，根据症状望、闻、问、切，根据舌苔、脉象采取不同的治疗。甲状腺结节中医认为是肝气郁结、痰凝血滞，在治疗的过程中会使用活血散结，疏肝解郁的中药，使用周期也比较长，通常甲状腺结节的治疗周期3个月为一个疗程，所以相对治疗的周期比较长。
在使用的过程中会用到，比如土贝母、石见穿、莪术、柴胡等相关的药物，进行软坚散结，起到一定的效果。另外还会配中成药，配中成药是因为治疗的时间太长，让病人连续吃3个月，6个月，9个月的中药很困难，通常刚开始用汤药，病人吃不下去的时候，合并用中成药，这些中成药也有软坚散结的作用，可以吃一段时间，对这些结节还是有帮助。
中医内分泌科还专门发明了治疗甲状腺结节的甲状腺结节穴位贴，贴在甲状腺的部位上，临床实验发现确实有变小的作用，只不过作用比较缓慢，部分会导致过敏。目前就是口服、外用甲状腺结节贴这两种方法。