胃底贲门部有肿瘤，此时的处理方法需依据肿瘤性质而定，具体如下：

1、良性肿瘤：若是良性肿瘤，如息肉、腺瘤性息肉。此时问题不大，一般通过内镜下局部治疗可在胃内镜下切除息肉，术后患者定期随访即可；

2、恶性肿瘤：如胃底贲门癌，需要进行手术治疗。连接食道和胃的交界部分称为贲门，贲门左上方称为胃底，若是胃底贲门癌就要做手术。此时的手术方式两种，一种是全胃切除，若胃底贲门癌有局部侵犯、肿块较大 、淋巴结浸润，此时要进行全胃切除切除，切除后再做消化道重建；若胃底贲门癌较早期，也可选择近端胃癌根治术，即切掉食道、近段胃窦、胃体、胃底，但保留1/3-1/4的胃窦。保留一部分胃窦可维持一定的胃功能，有利于术后恢复和营养物质摄入。因此，若胃底贲门部出现恶性肿瘤，一般要进行以手术为主的综合治疗，手术以后给手术标本进行临床分期。若发现术后有区域性淋巴结转移，还要加术后化疗等辅助治疗，且术后化疗还要定期随访。因此，若是胃底贲门部的恶性肿瘤，一般进行以手术为主的综合治疗。