房间隔缺损手术的后遗症相对较少，同时发生率也较低。房间隔缺损属于常见的先天性心脏病，手术成功率和成熟度相对较高。如果手术成功，同时患者术后恢复良好，通常不会留下任何后遗症。患者可以从事正常的工作和劳动，但需要定期复查心脏的功能，包括心脏超声、心电图以及胸片等。房间隔缺损手术的后遗症主要如下：
1、房间隔缺损再通：房间隔缺损通过手术修补后可能存在残余分流，但残余分流较少患者能够自愈；
2、心律失常：任何心脏手术完成后都有可能引起心律失常，因修补房间隔缺损时常触碰神经导致。因此患者需要长期随访，建议患者在手术之后的1个月、3个月、6个月、1年，直到手术后的5年内都要进行随访；
3、营养不良：部分患儿房间隔缺损手术后营养不足，建议家长尽心配合患儿的术后恢复，加强营养。
