对于反流性食管炎的患者来说，不存在吃什么药最有效这种说法，药物的选择是多种多样的，只能说适合患者的药物才是最有效的。临床上医生一般指导患者服用拉唑类的抑酸药物，在药物选择上建议选用单日服用剂量小、不良反应少、安全性高，而且抑酸时间比较长的药物。
例如新一代的拉唑类药物艾普拉唑肠溶片，抑酸时长在23小时左右，所以即使是夜间睡觉的时候，药物也能发挥作用，基本不会出现半夜被反酸水呛醒的情况，可以有效缓解反流性食管炎的不适症状。除此之外，H2受体拮抗剂包括盐酸雷尼替丁胶囊等，能够与胃壁的H2受体结合，从而抑制胃酸的分泌，缓解反流症状。还有枸橼酸莫沙必利分散片、盐酸伊托必利片、多潘立酮片等促胃动力药，能够增强并协调胃肠节律性运动，从而缓解反流性食管炎的相关症状。
在治疗期间，患者要避免吃辛辣刺激性食物和生冷食物，尽量不要喝咖啡和浓茶，以免引起不适。
