便秘并非身体缺少某种物质，多提示结肠运动紊乱。结肠运动依靠神经递质支配，所以一些促动力药有治疗效果，比如莫沙必利等。便秘可能提示患者肠道里的5-羟色胺作用不强，使用提高5-羟色胺含量的药物治疗有效，顽固性便秘患者可以使用抗抑郁药进行治疗。

中医认为便秘分气虚便秘、血虚便秘、阴虚便秘等，属于虚证，辨证为虚证的患者要通过滋阴温肾方法进行调理。