运动后，小腿疼痛，主要原因具体如下：

1、小腿后三头肌拉伤：小腿后三头肌支撑跳跃、运动等，损伤后会引起小腿后侧肌群疼痛；

2、骨性疼痛：包括膝关节损伤、创伤性关节炎、半月板损伤、踝关节损伤等，相应的会连带小腿疼痛较明显；

3、腰椎疾病：包括椎间盘突出症、腰椎椎管狭窄症，除疼痛外，还可能合并麻木、无力等现象；

4、钙丢失较多：血钙受较大影响，导致小腿痉挛。