水土不服、肠胃不舒服可以吃黏膜保护剂，包括硫糖铝，以及制酸剂，如铝碳酸镁、铝镁加混悬液、康复新液等，还可服用蒙脱石散，具有肠胃黏膜保护作用，也有收敛的作用。
另外，还可以通过多喝水，来稀释摄入不好食物成分的浓度，减轻肠胃的刺激，将水土不服的食物成分排出，从而使肠胃不舒服得到缓解。
水土不服、肠胃不舒服的人群还可以应用解除痉挛药物，如马来酸曲美布汀、颠茄片等，能够缓解肠胃的不舒服。
水土不服实际根本的是要切断刺激来源，即减少接触，再对症治疗，如应用黏膜保护剂等。如果有腹泻情况，就给予黄连素止泻，但建议还是查大便的常规。
如果有恶心、呕吐等症状，可以检查呕吐物，没有发现感染就用对症治疗，如吗丁啉止恶心、黄连素止腹泻、蒙脱石散进行收敛等。
