严重肺部感染并发呼吸功能障碍、呼吸衰竭情况下需要进行插管。插管的副作用首先为局部损伤，因为插管属于外源性人工气道管路，人工气道置入后带来局部气道黏膜损伤、血管神经损伤。

间接损伤指气管插管为人工气道，建立人工气道将本身下呼吸道相对无菌状态和外界进行开通，气体通过鼻腔进行湿化和过滤后再进入到下呼吸道。如果进行气管插管后过滤和湿化作用相对解除，建立气管插管和外界沟通后可能造成感染，是直接导致病情加重的副作用。