医生可以把血管钳上涂上石蜡油，把结石钳出来，但很多病人很痛，需要打麻醉，然后用膀胱镜或输尿管镜把结石从尿道再推回到膀胱，再用激光打碎变成粉末状，自然就会通过尿道排出。处理方法其实很简单，但病人可能很痛苦，在阴茎头端能摸到超硬的结石，这种情况要到医院进行急诊处理。
尿道口指阴茎头端，有时结石通过上尿路排到膀胱后，基本上通过尿道都能较顺利排出。若在尿道口排不出往往结石的形态不规则，在尿道口腔上有舟状窝，这个地方有一定的狭窄，所以病人结石可能排到尿道口，在阴茎头端出不来，但女性病人很少有这种情况，病人的症状主要是疼痛、排尿困难，结石有时就在尿道口。
