阴天下雨出现肩部疼痛是因为温度较低、湿度较大时，肌肉、筋膜会出现与温度、湿度相关反应，造成疼痛表现。一般原来有伤部位，骨折、筋膜炎、伤口、刀口等有伤部位对空气温度、湿度较为敏感，所以阴天下雨时肩部出现疼痛。主要原因是肩周炎、肩膀肌肉痉挛、炎性反应等，说明肩部存在原发疾病。

颈椎病患者在阴天下雨时也可以出现颈痛、肩痛、手麻、头痛、失眠，所以阴天下雨存在疼痛说明组织存在一定问题。