通常挂消化内科的普通号、专科号、专家号都会常规开具胃肠镜检查单，但普外科全科有所需求，患者做胃肠镜时医生会开具胃肠镜申请单。如果患者不太清楚是否需要做胃肠镜，需先到消化内科就诊，医生会根据患者主诉、家族史各方面了解，决定是否有必要近期进行胃肠镜检查。

胃肠镜检查需要注意的事项需询问消化内科医生，挂消化内科得到的准确答复较多。全科医生及普外科医生考虑角度不同，全科医生多数基于筛查流行病学及全国普查，而普外科医生多数考虑有没有长消化道肿瘤，才会考虑要做胃肠镜术前检查。