桥本氏甲状腺炎是一种器官自身免疫性疾病，现在还没有针对病因的治疗措施，但是有些专家建议限制碘的摄入，可能有利于阻止甲状腺自身免疫破坏的进展，但是限制碘盐或者限制碘，一定要保证机体的碘在安全范围，对普通人而言，尿碘的中位数在100-200μg/L。
桥本氏甲状腺炎的诊断是血清中过氧化物酶抗体增高或者阳性，为本病诊断的金标准。临床表现主要是甲状腺肿大或者甲状腺功能减退。因此临床治疗可以针对这两种情况，比如甲状腺肿大，患者可以忍受，没有明显压迫症状，只是轻度肿大，不用特殊处理。如果肿大明显，出现压迫症状或者影响美观，可以做手术。另外，甲状腺功能减退也属于原发性甲状腺功能减退，一定要做甲状腺激素替代治疗，通常用左甲状腺素替代治疗，使TSH达到安全范围即可。
特别要补充的是，如果本病做了甲状腺手术，患者可能会很容易形成永久性甲减。
