肥厚型梗阻性心肌病可以通过起搏器治疗来达到很好的效果，起搏器治疗通过心室电极放到心尖部，通过术后程控房室收缩顺序，或者通过调整心室收缩顺序，可以达到解除梗阻、缓解患者症状或者延长患者寿命的作用。
但是临床上可能更多见对肥厚型梗阻性心肌病的治疗，是通过外科手术或者通过内科化学消融、射频消融治疗。对于药物效果治疗差，又没有条件进行外科手术，或者内科介入进行消融的患者，心脏起搏器治疗是一个非常好的选择，通过调整房室顺序和心室收缩顺序能够缓解梗阻，缓解患者症状。
总之，肥厚型梗阻性心肌病患者通过植入起搏器，通过术后程控改变房室顺序和心室起搏顺序，能够起到缓解梗阻，缓解症状，达到很好的治疗效果。