目前核酸检测是使用咽拭子筛查，通常不会使人难受，其主要目的是为了检测出无症状感染者。护士操作时会在咽腔两侧，即咽腭弓处，各擦拭三次，有时可能在咽喉壁还会轻微旋转。咽拭子有两个面，且均是粗糙面，在轻微旋转时可以擦拭分泌物，因此不会对受测者造成不适感。但是部分人群反应较敏感，可能会出现干呕、咳嗽等情况，建议受测者尽量忍着，待护士检测完毕后，可以回头再咳两声，不适感即可消失。
通常不予以鼻拭子和肛门拭子，鼻拭子如果探得比较深，会使人产生不适感，甚至部分人群会被摩擦出血。需做鼻拭子的人群，通常是从国外归来、在外人士或者外籍人士，或者已经确定属于密接者，在隔离过程中可能会做鼻拭子或肛拭子，需要配合医护人员的检查，且通常不会使人难受。在做核酸检测排队的过程中，注意人和人之间保持距离，以免发生交叉感染。
